1999年7月至2008年12月任浙江大学人文学院常务副院长，另兼任浙江省学位委员会委员、浙江省文学学会会长等。曾在香港浸会大学（1997年9月至1998年6月）、意大利特伦托大学（2002年2月至3月）、美国哈佛大学哈佛·燕京学社（2002年9月至2003年7月）、法国社会科学高等研究院（2005年1月至4月）做访问学者。2009年9月调入北京大学中文系、中国古文献研究中心任教授，2012年11月起任中国古文献研究中心主任。兼任北京大学人文学部副主任、中文系学术委员会主任。另为国家古籍整理出版规划领导小组成员、国家社科基金学科评审组专家、中国俗文学学会会长、中国古代戏曲学会副会长、中国明代文学研究会（筹）副会长。

曾承担国家哲学社会科学基金课题《明代文学思潮研究》、教育部全国高校古委会课题《稀见明代戏曲整理与研究》等。著作《明代文学复古运动研究》1998年获教育部第二届人文社会科学优秀成果二等奖。作为第一完成人完成的项目《基于“博雅专精、明体达用”理念，构建按大类培养人文学人才的新模式》,2009年获第六届国家级优秀教学成果二等奖。入选首批“新世纪百千万人才工程”国家级人选（2004年）、教育部长江学者特聘教授（2016年）。